بسیاری از قارچ ها دارای خواص دارویی هستند. به عنوان مثال، در کشور ما باستان، سرمازدگی با عصاره قارچ پورسینی درمان می شد. معلوم شد که همان قارچ ها قادر به جلوگیری از توسعه نئوپلاسم های بدخیم هستند. کت های بارانی نشان داده اند که یک عامل خونساز و ضد عفونی کننده عالی برای بریدگی و خونریزی هستند. اسفنج کاج اروپایی در هنگام حمله آسم وضعیت بیمار را کاهش می دهد و با یرقان، لوسترها و برخی از انواع روسولا از تولید مثل استافیلوکوک جلوگیری می کند. و قارچ ها ادعا می کنند که یک آنتی بیوتیک طبیعی هستند، و همچنین قارچ ها، که در برابر انواع مختلف عفونت های تنفسی و روده مقاومت می کنند. آنها مانند قارچ صدفی سیستم ایمنی را تحریک می کنند و متابولیسم لیپید را بهبود می بخشند.
برخی از انواع روغن حاوی ماده ای هستند که سردرد را تسکین می دهد. علاوه بر این، آنها برای استفاده در حملات نقرس توصیه می شوند، اما قارچ شیتاکه عجیب خاور دور به عنوان یک تعدیل کننده ایمنی عالی شهرت پیدا کرده است. به همین دلیل است که می توان آن را نه تنها در سوپرمارکت (خام)، بلکه در داروخانه (به شکل دارو) خریداری کرد. در چین و ژاپن، این قارچ ها به دلیل توانایی آنها در افزایش قدرت (به دلیل محتوای بالای روی) ارزش دارند. با این حال، افرادی که از نقرس و سنگ‌های ادراری رنج می‌برند، نباید با قارچ‌ها (مخصوصاً شامپینیون و خوک‌ماهی) غافل شوند، زیرا می‌توانند باعث تشدید این بیماری‌ها شوند.