عفونت های قارچی اغلب از عدم تعادل ساده میکروارگانیسم ها به طور طبیعی در بدن بوجود می آیند.

در واقع توسط بسیاری از قارچ ها و باکتری های مختلف مستعمره شده است ، در بیشتر مواقع بی ضرر و حتی برای عملکرد مناسب بدن ضروری است.

با این حال ، ممکن است برخی از این قارچ ها تکثیر شده و بیماری زا شوند ، یا یک قارچ "خارجی" که برای مثال توسط یک حیوان منتقل می شود ، باعث عفونت شود. در مجموع 200-400 گونه قارچ می تواند باعث ایجاد بیماری در انسان شود⁵.

با این حال ، قارچ های موجود در محیط نیز می توانند انسان را آلوده کنند ، به عنوان مثال:

• با تلقیح ، به عنوان مثال در هنگام آسیب (منجر به اسپوروتریکوز یا کرومومیکوز و غیره) ؛
• با استنشاق قالب ها (هیستوپلاسموز ، آپرژیلوز و غیره) ؛
• در تماس با یک فرد آلوده (کاندیدیازیس ، کرم حلقوی و غیره) ؛
• از طریق تماس با حیوان آلوده